定植后的有机蔬菜栽培管理主要有科学的肥水、光照、温度、空气的管理，必要的整枝理蔓和人工辅助授粉及病虫害生态防治等。

1 肥水管理

有机蔬菜栽培初次定植滴灌带喷滴水量以将基质充分湿透（微有少量水从排水孔流出）为宜，以后的肥量主要根据蔬菜的长势及生育期通过合理调节有机营养液的浓度来控制，水量调节则根据具体情况而定。

2 病虫害生态防治方法有机蔬菜水肥一体化

保护地设施无土栽培，由于人为采用科学的消毒、隔离等生态措施，有效阻断了病原菌和外源虫害的侵染，使蔬菜在生长过程中不发生或很少发生病虫害，需要注意的是，在栽培管理过程中，员工进入大棚要进行必要的消毒以及注意穿戴专门的工作服等，严防人员带菌带虫入棚。

3 其他管理

有机蔬菜栽培中对于其他如光照、温度、空气的控制管理以及茄果类、瓜类蔬菜的理蔓整枝等方法与一般的栽培管理相同。由于是保护地栽培，部分瓜果蔬菜利用蜜蜂或人工辅助授粉，可以提高产量，但绝对不可用化学合成的人工激素。