栽培所用的石砾以花岗岩碎石最为理想，粒径在5～15mm,要求质硬而未风化，棱角较钝，不会因为摩擦对植株的根颈部造成伤害。尽量不选用石灰性的石砾，因为石灰质石砾中的CaCO3能与营养液中的不溶性磷酸盐作用，生成不溶性的Ca3(PO4)2和CaHPO4，严重降低营养液中有效磷的浓度。采用石灰性石砾时，要作专门的处理。可用浓度为0.5～5.0g/l的重过磷酸钙溶液浸泡石砾数小时，定时测定浸泡液中水溶磷的浓度，开始时会不断降低，当降到P10mg/l以下时，需将旧浸泡液排去，换上新的，再浸泡、测定，直至浸泡液的水溶磷含量稳定在P30mg/l和pH6.8左右时，将浸泡液排去，用清水清洗数次，即可使用。此时石砾的颗粒表面包上一层不溶性磷酸三钙，抑制了碳酸钙的溶出。当经过多次使用，石砾表层的磷酸三钙层被磨损掉，碳酸钙重新暴露再起作用时，应重新浸泡处理。

即使选用非石灰性的石砾具有一定的置换、吸附、溶出多种离子的性质，如果使用前不进行处理会干扰营养液的稳定，引起作物缺素症的发生。处理方法是将石砾用清水洗净，首先除去混入的腐殖质和粘土，然后用营养液浸渍循环多次，并测定流出的营养液中的P、K、Ca、Mg、Fe、pH等的变化，如变化较大，则要再换新的营养液循环，直至营养液的组成趋于稳定时才可使用。