在基质栽培条件下，植物营养供应完全来自营养液。因此，绝不能套用土壤栽培的水肥管理经验，应根据植物需求与不同的生长周期，精准确定营养液配比、浓度、pH值，以及滴灌的频率、时间段、用量。

1、温度：根据具体的品种的要求给以适当的温度，大多数种子的发芽温度在20-25℃之间。温度太高和太低都会直接影响种子的发芽率。

2、湿度：播种后水分的管理是很关键的。冬季育苗夜间土温低时，水分散失少，因此在苗期不需要补水或者少补水；如果土温较高，在苗期应根据实际需要喷雾补水。夏季育苗时，水分蒸发特别快，必须根据实际情况随时补充水分。如果种子很细，为避免水的冲刷，可以采用浸盆的方法补水。

3、光照：除个别品种像仙客来在萌发时需要黑暗之外，大多数种子在光照条件下有利于萌发。种子萌发后必须接受光照，否则会使幼苗徒长。

4、揭去覆盖物：种子发芽后，要及时揭区覆盖物。有60%－70%的种子在子叶展开后应将膜揭去，以免幼苗徒长。同时仍然要保持基质的湿度，从而使未发芽的部分种子的子叶从种壳中成功伸出。

5、移植：种苗生长到适合移植的时候，要及时假植或定植，否则容易造成种苗徒长和生产延误。各种种苗移植的时间各不相同，需根据实际情况决定。