栽培基质的配制是有机生态型无土栽培的一个核心内容。进行有机生态型无土栽培，首先要配制适合多种作物生长的广普性基质。栽培基质的原料分为两大类，有机的和无机的。

1、无机基质：无机基质材料较多，沙子、蛭石、珍珠岩、陶粒等都可以作为原料，除此以外，很多地方还有比较廉价丰富的如炉渣、煤矸石、风化煤等。成本不高，取材方便，理化性质符合要求都可以使用。材料的粒径不应太大，一般应过2厘米的筛子，选留粒径较小的。

2、有机基质：我国天然有机物非常丰富，每年仅各种农作物秸秆产量就有近5亿吨，很多都被焚烧或扔掉，十分浪费，还带来严重的空气污染等问题。

3、有机生态型无土栽培技术着眼于天然有机物的变废为宝和高效利用。采用菇渣、各种作物秸秆配制栽培基质，种植效果都非常好，作物产量高、味道好。采用丰富廉价的农产废弃物配制基质，比起用草炭来，每亩地成本可降低1000多元，而且这些东西可以不断再生，既便宜又环保。

4、有机基质的发酵 ：在用这些有机物配制栽培基质之前，需要进行一些处理，先用粉碎机粉碎，然后高温堆放发酵降低碳氮比，发酵还有消毒杀菌的作用。

5、基质的混配：采用2～3种有机基质材料、1～2种无机基质材料进行混配，效果比单一的有机基质或无机基质要好得多。如果混合的基质较多，最好用机械混匀。